基督教是16世紀宗教改革運動中脫離出來的新教派和後來繼續分化出來的眾多新宗派的統稱,它強調因信稱義、信徒人人都可為祭司和《聖經》具 有最高權威三大原則,反對崇拜聖像和聖物,拒絕天主教的彌撒,而採取講道、同唱讚美詩等崇拜儀式的改革。
台灣基督教主要派別有長老教會、改革宗長老會、信義會、浸信會、衛理公會、聖教會、基督復臨安息日會、真耶穌教會、神召會、門諾會、循理會、協同會、貴格會、拿撒勒人會、錫安堂、宣道會、基督教中華聖潔會、行道會、教會聚會所、國語禮拜堂、靈糧堂、佈道會、路德會、基督喜信會等。
台灣基督教傳入台灣,最早可朔至1865年6月16日由蘇格蘭的馬雅各醫生(James Laidlaw Maxwell,1836年-1921年)代表英國長老會在台南開設醫院開始;台灣北部的傳教工作最早則是加拿大長老會的牧師馬偕博士(George Leslie Mackay,1844年—1901年)在1872年3月7日從淡水開始。馬偕在台傳教29年,建立60所教堂,包含滬尾淡水、艋舺(今萬華)、錫口(今松山)、大稻埕、五股、苗栗、台北、基隆、新竹...等,並創立牛津學堂(今天的台灣神學院、真理大學前身)。1951年3月7日,南部的英國長老教會和北部的加拿大長老教會,因為神學立場及母會淵源旋即於二次大戰結束合併成立「台灣基督長老教會」。臺灣基督長老教會為基督教最大組織,屬加爾文(歸正教派)系統。今台灣基督長老教會約 有1218個堂會,會友人數217,280人。